人全基因组重测序

人全基因组重测序(WGS)是对人类不同个体或群体进行全基因组测序，通过序列比对，找到大量的单核甘酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(Insertion/Deletion, InDel)、结构变异位点(Structure Variation, SV)和拷贝数变异位点(Copy Number Variation, CNV),可全面挖掘DNA水平的遗传变异，为筛选疾病的致病及易感基因，研究发病及遗传机制提供重要信息。全基因组测序是全基因组范围的突变，包括外显子区、内含子区、调控区，对检测拷贝数变化和基因重排具有无可替代的作用。

智数生物人全基因组重测序(WGS)服务采用华大智造DNBSEQ测序平台开展，依托其核心测序技术与成熟的实验体系，在数据准确性、检测稳定性与项目交付效率上具备突出表现。

优势 01

滚环扩增构建DNB测序文库，PCR-free重测序检测lnDel更精准，无index hopping之忧, 低dup rate无需人为干预。

优势 02

DNBSEQ-T20超高通量，
周期短、性价比高。

产品应用

人群数据库构建

队列研究

健康计划

药物研发

复杂疾病研究

肿瘤研究

技术流程

样本检测

文库构建

上机测序

数据质控

基本信息分析

案例分析

ChinaMAP发布最大规模中国人群全基因组测序和表型研究成果

研究背景

研究策略

研究结果

代谢疾病已成为全球范围内主要的公共健康挑战，解析代谢性状的遗传架构是开展这类疾病风险评估、精准防控与治疗的关键，而人群特异性的大规模基因组参考数据集更是相关药物研发和精准医学研究的基础。目美国和欧洲已实施多项以大规模队列的基因分型、基因组测序数据为基础的医学研究计划，包括著名的英国生物样本库(UK Biobank)，美国肿瘤基因组图谱(TCGA)计划和多组学精准医学研究计划(TOPMed)等，产生了一系列具有深远影响的里程碑式成果。但东亚人群尤其是中国人群的高深度全基因组测序研究严重缺失，现有相关数据多为低深度测序，对稀有变异的检测和个体变异的准确性有限，且东亚与欧洲人群存在显著的遗传背景和种群特征差异，因此亟需构建代表中国人群的高质量基因组数据库，填补人类遗传多样性研究的空白，为中国乃至东亚人群的代谢疾病研究提供专属的核心资源。

基于中国三大大型队列（2010 年中国非传染性疾病监测、REACTION 研究、上海城市化心血管风险研究，共约 45 万受试者），随机选取中国 27 个省份、8 个民族（汉、回、满、苗、蒙古、彝、藏、壮）的 10588 名受试者，无偏倚筛选，收集完整表型信息和生物样本。提取基因组 DNA 后采用 BGISEQ-500 平台进行40.80× 深度全基因组测序，结合 PCA、ADMIXTURE 等解析种群结构，通过 PRS、单变异关联分析等挖掘代谢性状遗传位点，同时分析营养与药物代谢的基因组特征，最终搭建 ChinaMAP 公共数据浏览器。

构建高质量基因组数据集：获得超 1.47 亿个变异位点（SNP+Indel），近 50% 为新型变异，变异分布呈现中国人群明显的地域、民族特征；解析致病性变异特征：发现中国人群特有致病性变异谱，甲状腺功能相关基因致病性变异频率远高于国际数据库，部分变异易诱发先天性甲减；明确中国人群遗传结构：与东亚人群遗传相似度高，与欧美非人群差异显著；汉族可细分为 7 个遗传聚类，少数民族遗传特征与历史迁徙相契合；挖掘代谢性状新遗传位点：验证了糖尿病已知相关基因，同时发现血糖、BMI 相关新位点，基于东亚数据的遗传风险评分对 2 型糖尿病预测更精准；揭示营养与药物代谢特征：中国人酒精代谢能力整体偏低且南北 / 民族差异大；超半数人对氯吡格雷代谢能力弱，几乎所有人需调整华法林、辛伐他汀等常用药剂量；搭建公共研究资源：建立 ChinaMAP 数据浏览器，开放变异相关信息，填补东亚人群高深度基因组数据库空白。